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                        DIA定量蛋白質(zhì)組學分析


                        ?基于二級質(zhì)譜信號的定量蛋白質(zhì)組技術(shù) 
                        ?數(shù)據(jù)覆蓋度高,定量重現(xiàn)性好

                        ?不需混樣、開啟個體化蛋白質(zhì)組學分析新篇章

                        ?避免實驗操作體系影響,回歸大樣本統(tǒng)計分析,數(shù)據(jù)更可靠

                         

                        差異定量方法比較TMT/iTRAQDIA
                        數(shù)據(jù)采集方式

                        DDA

                        選擇豐度高的離子碎裂,數(shù)據(jù)采集具有一定隨機性; 只能根據(jù)母離子/報告離子定量,無法提取離子對定量,隨機性較大,準確性、重現(xiàn)性較差。

                        DIA

                        所有離子完全采集,無數(shù)據(jù)丟失;重現(xiàn)性好;高通量定量分析。

                        優(yōu)勢

                        混合上機,質(zhì)譜分析平行性好。

                        樣本數(shù)量較少,相對定量簡易。

                        方法成熟,參考文獻豐富,成本較低。

                        質(zhì)譜操作簡便不需分組分,樣本處理很少,軟件及數(shù)據(jù)庫快速發(fā)展提高效率。

                        DIA全掃描,蛋白鑒定重現(xiàn)性好,可高通量定量分析更多蛋白。

                        個體化分析,樣本數(shù)增加,統(tǒng)計學分析更具意義。

                        樣本基因表達差異影響?。ú煌课?、不同個體的樣本,均能分析)。

                        局限

                        基因表達情況接近的樣本(不能跨部位),為消除個體差異帶來的影響,科研上很多時候還需要混樣。

                        樣品數(shù)受限(≤8標、≤10標);樣本數(shù)量較多時需設(shè)對照分多組,定量分析困難。

                        DDA掃描,蛋白鑒定重現(xiàn)性較差,獲得的差異定量數(shù)據(jù),必須進一步驗證。

                        采用DIA數(shù)據(jù)采集方式,對質(zhì)譜儀器平臺要求高。

                        數(shù)據(jù)量大,對方法及軟件效率要求高。

                        若大樣本檢測,檢測成本相對提高。

                        相關(guān)文獻:

                        Liu Y, Chen J, Sethi A, et al. Glycoproteomic analysis of prostate cancer tissues by SWATH mass spectrometry discovers N-acylethanolamine acid amidase and protein tyrosine kinase 7 as signatures for tumor aggressiveness[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2014, 13(7): 1753-1768.

                        Liu Y, Buil A, Collins B C, et al. Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population[J]. Molecular systems biology, 2015, 11(2): 786.